Cầu Thanh Trì có điểm đầu tại Pháp Vân và điểm cuối tại thị trấn Sài Đồng, Gia Lâm (giao cắt quốc lộ 5).

Theo ông Vũ Xuân Hòa, Tổng giám đốc Ban quản lý dự án Thăng Long, đơn vị đang phối hợp với chính quyền địa phương và các đơn vị thi công giải phóng mặt bằng và thi công 2 gói thầu đường dẫn phía bờ Bắc và Nam nhằm sớm đưa vào khai thác toàn bộ dự án vào 3/2008. Hiện các xe phải lên cầu bằng các tuyến đường nội đô. 

Sở Giao thông công chính Hà Nội đã lên kế hoạch phân luồng phương tiện qua cầu Thanh Trì. Các xe không hạn chế tải trọng sẽ lên cầu từ phía bắc tại nút giao quốc lộ 5 và quốc lộ 1B. Phương tiện đi theo đê tả Hồng (phải hạn chế trọng tải 10 tấn) lên và xuống cầu theo đường gom và đường dẫn.

Các xe qua cầu Thanh Trì từ phía nam, xe tải trọng dưới 13 tấn theo đê Hữu Hồng, được lên cầu Thanh Trì tại điểm đấu nối đường dẫn đầu cầu tại dốc đường Lĩnh Nam.

Cầu Thanh Trì sau khi đi vào khai thác sẽ giải tỏa sức ép giao thông đang đè nặng lên cầu Chương Dương (Hà Nội), đồng thời phân bổ và giảm bớt đáng kể lưu lượng xe, nhất là xe tải, lưu thông qua nội thành Thủ đô.

Cùng với đường vành đai 3 (Hà Nội), cầu Thanh Trì nối quốc lộ 5 với quốc lộ 1, liên kết vùng tam giác kinh tế Hà Nội - Hải Phòng -Quảng Ninh với trục giao thông Bắc Nam, thúc đẩy sự phát triển kinh tế xã hội của đồng bằng Bắc bộ và thủ đô Hà Nội nói riêng.