Theo cáo trạng, khoảng 22 giờ ngày 3/11/2011, Trần Văn Phước đến quán cháo của chị Lê Thị Ngọc Mai (Mai và Phước đang chung sống với nhau như vợ chồng) tại đầu hẻm 462 đường 3/2, P.12, Q.10 để phụ chị Mai dọn quán. Lúc này, Phước thấy chị Mai đang ngồi nhậu với Phan Văn Thiện nên ghen tức và tát chị Mai. Đồng thời, Phước quay sang Thiện có ý trách móc Thiện, do đó cả hai cãi vã và đánh nhau gây ra thương tích nhẹ cho cả hai.

Khi Phước đang đứng đợi cháu là Nguyễn Hoàng Châu đưa đi băng bó vết thương thì thấy Thiện đi ngang qua có ý thách thức Phước. Tức giận, nên khi Châu đến, lúc 0 giờ15 phút ngày 4/11/2011, Phước bảo Châu chở đến nhà Thiện trên đường 3/2.

Tại nhà Thiện, Phước đã dùng vỏ chai đã bị vỡ đâm vào đầu Thiện. Sau khi gây án, Phước đến Công an P.12, Q.10 đầu thú. Thiện được người nhà đưa đi cấp cứu, nhưng đã chết ngay sau đó.