Theo quyết định, cơ cấu tổ chức của Học viện Ngoại giao gồm viện Nghiên cứu Chiến lược Ngoại giao; viện Biển Đông; Trung tâm Đào tạo, Bồi dưỡng Cán bộ đối ngoại; Trung tâm Thông tin, Tư liệu; văn phòng; phòng Quản lý Khoa học; phòng Đào tạo; phòng Công tác chính trị, quản lý sinh viên.

Học viện còn gồm có khoa Đào tạo sau sại học; khoa lý luận chính trị; khoa Chính trị Quốc tế và Ngoại giao; khoa Kinh tế Quốc tế; Khoa Luật Quốc tế; khoa Truyền thông và Văn hóa đối ngoại; khoa tiếng Anh; khoa tiếng Pháp; khoa tiếng Trung Quốc.

Việc ban hành quy chế tổ chức và hoạt động; quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, cơ cấu tổ chức các đơn vị trực thuộc; bổ nhiệm, miễn nhiệm, cách chức người đứng đầu, cấp phó của người đứng đầu Học viện Ngoại giao và các đơn vị trực thuộc thực hiện theo quy định của Pháp Luật.

Quyết định có hiệu lực thi hành kể từ ngày 1/9./.