Theo Phòng Giáo dục quận 6, là trường công lập được ngân sách nhà nước trang bị phòng Lab (phòng sử dụng học tiếng anh và tin học) để học sinh học miễn phí nhưng từ 10 năm nay trường THCS Lam Sơn vẫn thu mỗi học sinh 10.000 đồng/tháng. Với nguồn thu tổ chức phục vụ bán trú từ năm học 2011-2012 THCS Lam Sơn thu thêm 48.000-120.000 đồng/tháng sinh so với quy định của Sở Giáo dục TP HCM.
Tiếp đó, từ năm 2013-2014 trong khi chờ hướng dẫn của Sở, trường này được cho là đã tự động thu trước 3 tháng tiền tổ chức phục vụ bán trú với mức 270.000 đồng/học sinh. Sau khi có quy định, số tiền thu 3 tháng này thừa ra hơn 211 triệu đồng.
thanh tra Giáo dục cũng cho rằng, cùng năm này, trường THCS Lam Sơn thu học phí tăng 60.000 đồng/tháng so với năm học trước, đề ra nhiều khoản thu khác như học phí tăng cường tiếng Anh, tăng cường Tin học mỗi môn 60.000 đồng/tháng; vi tính tự chọn là 25.000 đồng/tháng; cơ sở vật chất bán trú là 150.000 đồng/tháng...
Nhiều nguồn thu từ tiền lãi ngân hàng cũng được giải thích do kế toán "quên" không cập nhật vào sổ sách; giá cả thực phẩm mà trường mua để nấu ăn cho học sinh cũng cao hơn giá thị trường.
Ngoài ra, trường cũng bị cho là chi sai quy định tiền phụ cấp cho hiệu trưởng, hiệu phó; chi khen thưởng và bồi dưỡng lễ tết sai quy định lên hơn 1,3 tỷ đồng.
Đánh giá những sai phạm này của trường Lam Sơn là nghiêm trọng, Thanh tra Giáo dục quận 6 đã kiến nghị lên UBND quận xử lý kỷ luật đối với hiệu trưởng, kế toán và các cá nhân liên quan. Đồng thời thu hổi các khoản tiền trường đã thu và chi sai mục đích.
Trường THCS Lam Sơn được thành lập từ năm 1993, hoạt động dưới dạng là trường bán công. Đến năm 2006 trường chuyển sang trường công lập nhưng được tự chủ về tài chính. Hiện tại trường có gần 2.000 học sinh.
Trước đó nhiều giáo viên của trường bức xúc gửi hàng loạt đơn tố cáo lên cơ quan chức năng cho rằng hiệu trưởng lạm dụng chức vụ quyền hạn, không minh bạch trong thu chi và làm thất thoát tiền quỹ của trường.
