Ludogorets được thành lập vào năm 2001 trên nền tảng một đội bóng trẻ. Những năm đầu thế kỷ mới, Ludogorets nhiều lần giành quyền lên hạng ba, hạng cao nhất của các đội nghiệp dư, mà không đủ ngân sách thi đấu. Chật vật hoạt động, đội này phải chờ đến năm 2010 mới lên được hạng hai.

Mọi chuyện với Ludogorets thay đổi nhanh chóng khi được doanh nhân Kiril Domuschiev mua lại vào tháng 9/2010. Từ chỗ vật lộn hàng tháng với việc trả lương cho cầu thủ, ban giám đốc bắt đầu mua thêm ngôi sao. Ludogorets lên hạng cao nhất chưa đầy một năm sau đó.

Nếu như hành trình đi lên nhanh một thì quá trình lột xác nhanh đến mười lần. Ba mùa giải gần đây, Ludogorets đều giành chức vô địch Bulgaria. Ludogorets hiện cũng là một trong ba đội hiếm hoi, sau CSKA Sofia và Levski Sofia, giành cú ăn ba vô địch quốc gia, Cup quốc gia và Siêu Cup.

Để giành quyền dự Champions League năm nay, nhà vô địch Bulgaria đã vượt qua nhiều đối thủ xứng tầm như Partizan Belgrade, Steaua Bucharest. Ở trận ra quân vòng bảng, họ thậm chí đã có thể cầm chân Liverpool ngay trên sân Anfield nếu không có quả phạt đền gây tranh cãi ở cuối trận.

Mùa trước, Ludogorets cũng thi đấu thành công tại Europa League. Thầy trò Georgi Dermendzhiev lọt đến vòng 16 đội sau loại Lazio, PSV Eindhoven và Dinamo Zagreb.