Theo đề án này, giai đoạn 2014-2015, bên cạnh công tác đào tạo nguồn nhân lực, tỉnh sẽ đầu tư xây dựng bệnh viện huyện Trường Sa, Trung tâm thu nhận và điều trị bệnh đặc thù vùng biển, đảo tại bệnh viện Quân y 87, có thể triển khai các kỹ thuật ngoại khoa tương đương bệnh viện hạng 2.

Sang giai đoạn 2016-2020, tỉnh tiếp tục đào tạo, bổ túc bác sĩ về y học biển có đủ năng lực cấp cứu, khám chữa bệnh các bệnh lý đặc thù biển cho bệnh viện huyện Trường Sa và 70% các bệnh viện hoặc trung tâm y tế ven biển.

Ngoài ra, tỉnh Khánh Hòa thành lập mới Trung tâm Y tế huyện Trường Sa gồm: bệnh viện Đa khoa huyện Trường Sa và 3 Trạm Y tế tại xã Sinh Tồn, xã Song Tử Tây và thị trấn Trường Sa.

. Đồng thời, đầu tư cơ sở vật chất, trang thiết bị, nhân lực cho bệnh viện Đa khoa huyện Trường Sa với quy mô 30 giường bệnh, có thể triển khai các kỹ thuật ngoại khoa tương đương với bệnh viện hạng 2... Tổng kinh phí thực hiện đề án khoảng 77 tỷ đồng