Theo kế hoạch đã được thống nhất, Lễ hoàn táng sẽ cử hành vào 0h ngày 25/1/2010 tại Bảo tàng Lịch sử Việt Nam. Các đoàn sẽ bắt đầu viếng vào lúc 1h sáng. Sau đó, sẽ tiến hành lễ di cốt sang quan tài mới và khâm liệm. Trước khi rời khỏi Bảo tàng Lịch sử Việt Nam, các nhà sư sẽ tiến hành lễ cầu siêu cho nhà vua.

Đoàn lễ sẽ di chuyển khỏi Hà Nội vào lúc gần 5h sáng theo đường Hồ Chí Minh, về qua khu di tích Lam Kinh cáo tổ, sau đó về địa điểm hoàn táng và tổ chức lễ truy điệu. Quy mô đoàn lễ rước di hài vua dự kiến gồm 1 xe cảnh sát dẫn đường, 1 xe chở đoàn nhạc tế truyền thống, 1 xe chở quan tài và đội tiêu binh. Đã có nhiều tỉnh, thành trong cả nước đăng ký tham dự lễ hoàn táng này.

Vua Lê Dụ Tông sẽ mặc 1 bộ quần áo và 31 bộ khác sẽ được xếp trong quan tài. Lý do hoàn táng di hài nhà vua cùng với 32 bộ quần áo là khi phát hiện ra di hài nhà vua, nhà vua mặc tới 32 lớp quần áo. Tuy nhiên, việc hoàn táng không thể mặc đúng như cũ vì xương cốt đã khô. Số áo trên được các thợ thêu, may tại Huế thực hiện theo nguyên mẫu. Quan tài đặt di hài nhà vua được làm từ gỗ vàng tâm theo đúng kích thước chiếc quan tài cũ. Chiếc quan tài trước đây và 32 lớp quần, áo của nhà vua được Bảo tàng Lịch sử Việt Nam xin giữ lại làm hiện vật trưng bày.